Храм был заложен в 1891 году «в память избавления от опасности Их Императорских Величеств и Августейшего Семейства при крушении Императорского поезда 17 октября 1888 года». Строили церковь на частные пожертвования обоянских купцов.
Храм был закрыт и разграблен в 30-е гг прошлого века. В здании хранилось зерно, располагался мебельный склад. В середине 1950-х годов и в конце 1970-х были попытки взорвать его.
В 80-х в здании открылся молодёжный спортивный клуб. В 1991 г. храм возвращён Русской Православной Церкви. Началось его возрождение.
Кроме главного Престола владыка Герман освятил предел в честь священномученика Петра Обоянского. Он служил в Смоленском храме Обояни. В 30-е годы попал в жернова репрессий, сообщает с места корреспондент ГТРК «Курск».
